学院设有无机化学、分析化学、有机化学、物理化学、材料化学、药学、工艺与制剂7个教研室，1个实验教学中心。学院现有化学工程与技术一级学科硕士学位授权点，下设化学工程、化学工艺、应用化学、材料化学工程4个学科研究方向。设有化学工程与工艺、制药工程、应用化学、材料化学、药学和功能材料6个本科专业，1个化学工程与工艺”3+2贯通培养”专业。目前，在校生近2000人，其中硕士研究生83人。化学学科2018年、2019年自然指数排名连续位列全国农林院校首位，2020年成功进入ESI全球排名前1%。应用化学专业被列为国家，制药工程专业、化学工程与工艺专业、材料化学专业被列为山东省一流本科专业立项建设点。学院已发展成为涵盖化学、化工、药学和材料科学等四个理工类学科的教学研究型学院。

除承担本学院的专业课教学任务外，还承担全校30多个本(专)科专业的《普通化学》《分析化学》《有机化学》《物理化学》《基础化学实验》和《仪器分析》等公共课程的理论和实验教学任务。生物类《有机化学》《普通化学》和专业《无机化学》《分析化学》《有机化学》《物理化学》《专业基础化学实验》《仪器分析及实验》《化学分离与分析》《农药分析与残留》《波谱解析》《计算机在化学中的应用》等12门课程为山东省省级精品课程。另有5门课程为校级网络视频课程，11门课程按省级精品课程建设，15门课程按校级精品课程建设，8门课程按校级优秀课程建设，2门课程按院级重点课程建设。与青岛中一监测有限公司和青岛瀚生生物科技有限公司联合开办了“分析检验”培训班、“瀚生卓越农化班”。   

学院重视教学质量工程建设。先后主持省级教学研究和课程建设课题19项，教育部产学研合作协同育人项目5项，名校工程教研及课程建设项目60余项，其他各类校级课题50余项。生物类“有机化学”、“普通化学”和化学化工专业“无机化学”、“分析化学”、“有机化学”、“物理化学”、“专业基础化学实验”、“仪器分析及实验”、“化学分离与分析”、“农药分析与残留”、“波谱解析”、“计算机在化学中的应用”获评省级精品课程；“有机化学I、II”获评省级线下一流课程、“植物生长调节剂2,4-DI制备、质量控制与活性评价贯通实验”获评省级虚拟仿真实验教学一流课程。目前，已建和在建在线开放课程20门，特色课程5门。学院获得教学和实验技术成果获奖20余项，其中省级教学成果奖一等奖2项，二等奖1项，三等奖5项，省级实验技术成果奖2项；编写出版省部级规划教材15部。化学系列课程教学团队和应用化学专业教学团队是山东省省级教学团队。

学院建有农用生物药创制技术国家地方联合实验室，山东省生物农药工程技术研究中心，山东省动物新药创制与评价工程实验室，青岛市农用生物制药工程研究中心，青岛市农用生物制药国际科技合作基地以及青岛农业大学应用化学研究所和新农药创制研究所等7个学科平台，与美国北卡罗莱纳州立大学共建“病原微生物与新药开发”联合实验室。学院实验教学中心设有基础化学实验室、专业化学实验室（包括：无机及分析室、有机化学室、物理化学室、现代仪器分析室、综合化学室和材料化学室）、药学实验室（包括：药物合成室、药物分析室、制剂加工室和药理毒理室）、化学工程与工艺实验室（包括：化工原理室、化学工程室、化学工艺室、虚拟仿真室、化工中试生产室，化工实训平台）等4个综合教学实验室，实验室总面积达到16701.37平米，仪器设备总值达3800余万元。通过产学研结合建设了30多个稳固的校外教学科研实习实践基地。学院建有人工气候室，拥有稳态/瞬态荧光光谱仪、荧光分光光度计、高效液相色谱仪、气相色谱仪、气-质联用仪、傅立叶变换红外光谱、热重分析仪、高速自动比表面与孔隙度分析仪等先进大型教学科研设备70余台。化学实验室1999年被山东省教育厅授予山东省基础课教学A类实验室，2003年被评为山东省基础课教学示范中心。化学实验教学示范中心2021年被学校列为国家级培育项目。